Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms