Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H4Q92791 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
P3H4Q92791 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms