Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF4BQ92750 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4BQ92750 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms