Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABGGTAQ92696 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms