Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCSTNQ92542 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCSTNQ92542 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCSTNQ92542 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCSTNQ92542 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCSTNQ92542 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCSTNQ92542 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCSTNQ92542 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCSTNQ92542 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms