Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113Q902F9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms