Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CSRNP3Q8WYN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CSRNP3Q8WYN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms