Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4AQ8WYN0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4AQ8WYN0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms