Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DNAAF4Q8WXU2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAAF4Q8WXU2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms