Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC12Q8WVT3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC12Q8WVT3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms