Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC2Q8TF65 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GIPC2Q8TF65 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC2Q8TF65 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC2Q8TF65 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms