Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SH3RF3Q8TEJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3RF3Q8TEJ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms