Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRSK1Q8TDC3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.3 ms