Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms