Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO3Q8TAP4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms