Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEST2Q8NFU1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms