Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLIS3Q8NEA6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms