Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC197Q8NCU1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms