Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC2Q8NBF2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms