Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA6

C15orf53, Uncharacterized protein C15orf53, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf53Q8NAA6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C15orf53Q8NAA6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms