Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MFSD2AQ8NA29 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms