Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC89Q8N998 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms