Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RYBPQ8N488 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RYBPQ8N488 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RYBPQ8N488 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms