Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC2Q8N158 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms