Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIRREL3Q8IZU9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL3Q8IZU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms