Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRSK2Q8IWQ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK2Q8IWQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms