Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC83Q8IWF9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms