Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC6Q8IVU3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms