Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms