Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3FQ8IUX4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3FQ8IUX4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms