Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF39Q86UA1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF39Q86UA1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms