Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT28Q7Z3Y7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT28Q7Z3Y7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms