Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC29A4Q7RTT9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms