Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP2Q7RTS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTOP2Q7RTS6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms