Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
H2AFVQ71UI9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms