Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPUQ71F23 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPUQ71F23 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPUQ71F23 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms