Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms