Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM72Q6ZMU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM72Q6ZMU5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms