Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms