Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED9Q6R2W3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZBED9Q6R2W3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms