Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE2Q6PIF2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms