Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54Q6NXT1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms