Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC70Q6NSX1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms