Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDE2Q6IQ49 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms