Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CARMIL2Q6F5E8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL2Q6F5E8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms