Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms