Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CLQ60I27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms