Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM104BQ5XKR9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM104BQ5XKR9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms