Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHIC1Q5VXU3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms