Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms